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CRISPR-Cas9 est un outil d'édition du génome qui a bouleversé la recherche en génétique moléculaire. Mais d'après une nouvelle recherche, des souris modifiées par cette technique portent des centaines de mutations inattendues dans leur génome. L'outil semble plus risqué que prévu…

Ce qu'il faut retenir

  • Le système CRISPR-Cas9 est un outil de modification rapide et peu coûteux du génome.
  • Une étude a trouvé des centaines de mutations inattendues dans le génome d'une souris traitée par CRISPR-Cas9.
  • Ceci soulève de nombreuses interrogations quant à une possible utilisation de la technique chez l'être humain.

CRISPR-Cas9 est un outil d'édition génomique capable de modifier le génome de plantes, d'animaux et donc d'êtres humains, ouvrant ainsi la voie à d'immenses possibilités. Cette technologie qui a marqué une révolution dans les laboratoires consiste à utiliser une protéine qui se met en quête d'un gène particulier, coupe un morceau d'ADN et le remplace par un autre. Elle peut donc « corriger » un gène défectueux.

Cette technique a d'ores et déjà été employée pour modifier le génome d'animaux. Ainsi, des chercheurs ont-ils créé des vaches transgéniques résistantes à la tuberculose voici quelques mois.

Voir aussi :Des vaches transgéniques devenues résistantes à la tuberculose

CRISPR-Cas9 a aussi été employé pour modifier des embryons humains. Récemment, des chercheurs chinois ont modifié des cellules humaines avec cette technique. La Chine et les États-Unis sont entrés en compétition pour des essais cliniques qui devraient voir le jour prochainement. Mais alors que certains chercheurs commencent à tester CRISPR-Cas9 chez l'Homme, d'autres tirent la sonnette d'alarme sur les risques liés à des mutations inattendues.

Voir aussi :CRISPR : l’édition génétique testée pour la première fois sur l’Homme

Dans une nouvelle recherche à paraître dans Nature Methods, les chercheurs ont passé en revue tout le génome de deux souris sur lesquelles avait été utilisée la technologie CRISPR. Ils ont recherché des mutations dans le génome, y compris quand un seul nucléotide était modifié.

La protéine Cas9 est guidée par des ARN qui reconnaissent le site à couper dans le génome. © molekuul.be, Fotolia

La protéine Cas9 est guidée par des ARN qui reconnaissent le site à couper dans le génome. © molekuul.be, Fotolia

Des mutations indésirables dans des zones « hors cible »

Lors de ces travaux, la technique avait pu corriger avec succès un gène lié à la cécité des souris. Mais les animaux avaient aussi plus de 1.500 mutations où un nucléotide avait été changé, ainsi que 100 délétions et insertions plus vastes. Les animaux ne présentaient visiblement pas de problèmes particuliers.

“Il est essentiel que la communauté scientifique considère les dangers potentiels de toutes les mutations hors cible provoquées par CRISPR

Dans un communiqué, l'équipe explique : « Aucune de ces mutations d'ADN n'a été prédite par des algorithmes informatiques largement utilisés par les chercheurs pour rechercher des effets hors cible ». Les mutations n'auraient pas été détectées précédemment par les algorithmes car ceux-ci explorent plutôt les régions du génome qui ont le plus de chances d'être touchées, explique Science Alert. Pour Alexander Bassuk, de l'université de l'Iowa, « ces algorithmes prédictifs semblent faire un bon travail lorsque CRISPR est utilisé dans des cellules ou des tissus dans une boîte, mais le séquençage du génome complet n'a pas été employé pour rechercher tous les effets hors cible chez les animaux vivants ».

Stephen Tsang, de l'université de Columbia, qui a participé à ces travaux, s'inquiète de l'utilisation de CRISPR-Cas9 : « Nous estimons qu'il est essentiel que la communauté scientifique considère les dangers potentiels de toutes les mutations hors cible provoquées par CRISPR, y compris des mutations nucléotidiques et des mutations dans des régions non codantes du génome ».

Cette recherche paraîtra dans un article intitulé Unexpected mutations after CRISPR-Cas9 editing in vivo.

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